W produkcji masowej, jak oraz w indywidualnym wytwarzaniu medykamentów ziołowych, używane są różnorodne części rośliny. Ma okazję to być korzeń lub też całe systemy korzeniowe, jak np. w przypadku kozłka lekarskiego. Zazwyczaj trzon dobry oczyszcza się z mniejszych bocznych korzeni lub też okorowuje z brunatnego naskórka. Inną użytkowaną podziemną częścią rośliny są jej pędy. Wytarzają je m. in. zioła takie jak perz i tatarka.
W większości wypadków zbieranym surowce są liście oraz kwiaty - sklep z olejkami eterycznymi. Nieraz pozytywne działanie rośliny można ograniczyć zbierając, lub ewentualnie odcinając ogonki liściowe od blaszki. Jeśli zamierzamy wykorzystać kwiatostan, także należy uprzednio dowiedzieć się, czy będziemy potrzebować całych koszyczków kwiatowych, koron czy wyłącznie płatków jak w wypadku kwiatu róży. Innymi fragmentami roślin używanymi w lecznictwie są: owoce, nasiona, pączki i kora z młodych drzew i krzewów. Zioła posiadają też silny zapach. Dlatego również użytkuje się je do wyrobu olejków eterycznych, bądź też jako wielce cenione przyprawy kuchenne.